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文献导读|人生就是博-尊龙凯时:PhIP-seq技术在复杂感染性疾病研究中的应用

发布时间:2025-03-15   信息来源:尊龙凯时官方编辑

2019年11月,加利福尼亚大学旧金山分校的研究团队在《Nature Medicine》上发表了一项关于肠道病毒感染导致儿童急性无力脊髓炎(AFM)的研究。这项研究采用PhIP-seq技术及病毒组抗原库,对42名确诊AFM儿童和58名其他神经系统疾病儿童的脑脊液样本进行检测,筛选出与AFM病因相关的病毒特异性抗体。研究结果显示,肠道病毒抗体在AFM患者组中普遍富集,随后通过ELISA实验验证了这些发现。研究表明,肠道病毒感染可能是大多数AFM病例的根本原因。这一成果为肠道病毒脑脊液抗体测定方法的快速开发提供了良好的基础,有助于未来在临床上有效诊断与肠道病毒相关的AFM病例。

文献导读|人生就是博-尊龙凯时:PhIP-seq技术在复杂感染性疾病研究中的应用

人生就是博-尊龙凯时,AFM在2012年首次在美国被确认,此后全球已有超过500名儿童受到此病影响。每两年一次的疫情高发期与肠道病毒EV-D68型和EV-A71型的流行相关。然而,由于在<50%的患者样本(如鼻咽或口咽拭子)中检测到肠道病毒,而仅约2%的AFM儿童脑脊液中找到肠道病毒的核酸,因此其病因至今仍不明确。研究者对AFM的潜在致病机制表示担忧,认为可能涉及尚未识别的病原体或次级免疫反应。为了进一步探究AFM的发病机制,研究人员利用PhIP-seq技术分析了AFM儿童及对照组脑脊液中的病毒抗体谱,这种方法能够高通量识别数百种病毒特异性抗体,并用ELISA进行结果验证。

研究的主要发现如下:

结果一:PhIP-seq技术全面分析了AFM组儿童特有的病毒抗体反应,发现小RNA病毒(Picornaviridae科)的肠病毒(Enterovirus)属的抗体响应在AFM组样本中显著高于对照组。

结果二:数据分析显示,免疫原性抗原肽段源自整个肠道病毒基因组的蛋白质。序列分析表明,PhIP-seq技术不仅能够识别已报道的线性表位序列,还能够发现新的线性结合表位。

结果三:使用EV病毒VP1蛋白进行ELISA验证,结果显示在AFM儿童组的大多数脑脊液样本中(22/26)均能检测到EV信号,且与PhIP-seq的检测结果非常一致。

关于PhIP-seq技术,噬菌体免疫沉淀测序(Phage-immunoprecipitation sequencing, PhIP-seq)是一种高通量抗体谱检测技术,结合了高容量的噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀及高通量测序技术。此技术能够针对数十万种抗原进行血清抗体检测,全面绘制血清抗体谱,为免疫力相关研究提供有效工具。

PhIP-seq的基本原理是,通过选择目标抗原数据库,将每个蛋白切割成具有重叠区域的连续肽段,合成相应的DNA寡核苷酸并连接到载体中,形成多肽展示库。在样本血清与多肽抗原库孵育后,利用Protein G/A磁珠富集特异性抗体的噬菌体,并进行DNA PCR扩增、建库和测序,从而获取抗原多肽序列,进而分析血液中的抗体表位谱特征,探讨相关疾病的抗体组成。

该技术的应用方向包括:疾病生物标志物的筛选、病因学研究、免疫力解码研究及疫苗疗效评估。

关于公司,上海抗码芯瑞生物科技有限公司(简称“抗码芯瑞”)是由知名教授领导的科研团队创建,专注于蛋白组和抗体组的前沿研究已有20余年。公司致力于持续开发与转化抗体组学的前沿技术,并建立了PhIP-seq技术平台,开发了六大抗原组库,提供定制化抗原建库服务,同时开展基于PhIP-seq平台的高通量筛选、数据分析及验证等技术服务,为抗体组学研究提供综合解决方案。

如需了解更多信息,请联系:上海市闵行区园美路58号1号楼702;电话:021-62202128,400-8868-750;邮箱:info@abcodebiocom;官网:www.abcodearray.com。